Atheneskolen vægter musikfaget højt og klasserne har musik på skemaet fra skolestart. Musik tilbydes ligeledes også som valgfag senere i udskolingen.

Derudover har skolen et samarbejde med byensmusikskole.dk, der kommer efter skoletid og underviser på skolen i Atheneskolens musik faglokale; Typisk i direkte forlængelse af skoledagen eller fra SFO/klub.

Alle tilmeldinger og henvendelser sker via musikskolens hjemmeside eller på mail@byensmusikskole.dk (og ikke via Atheneskolen).

Musikskolen er desuden åben for, at man kan henvende sig direkte til dem, hvis der er behov for, at de åbner op for undervisning flere dage eller i flere/andre instrumenter end udbudt på et givent tidspunkt.